Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FAM3BP58499 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FAM3BP58499 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FAM3BP58499 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FAM3BP58499 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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