Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERFP50548 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERFP50548 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERFP50548 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERFP50548 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms