Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GRIA2P42262 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms