Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTGDSP41222 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms