Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ECHS1P30084 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms