Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MYF6P23409 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MYF6P23409 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms