Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR4A1P22736 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms