Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACADSP16219 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACADSP16219 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACADSP16219 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms