Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC159P0C7I6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC159P0C7I6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms