Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSP90AB1P08238 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HSP90AB1P08238 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms