Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NGFRP08138 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NGFRP08138 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NGFRP08138 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NGFRP08138 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NGFRP08138 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NGFRP08138 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms