Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms