Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ZNF208O43345 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ZNF208O43345 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF208O43345 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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