Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLEC4AQ9UMR7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.3 ms