Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SS18L2Q9UHA2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18L2Q9UHA2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms