Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms