Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4Q9UBX2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms