Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms