Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.192e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 SLC35D2-204ENST00000482643 754 ntTSL 522.3■■□□□ 1.162e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 SOX13-208ENST00000530882 769 ntTSL 322.04■■□□□ 1.122e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 CCDC91-219ENST00000544780 693 ntTSL 320.78■□□□□ 0.922e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.882e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.822e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 NOP53-204ENST00000595143 810 ntTSL 520.12■□□□□ 0.812e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.722e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.722e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.712e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.692e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.672e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 CLIP1-211ENST00000539080 560 ntTSL 419.06■□□□□ 0.642e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.645e-6■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 KATNBL1-211ENST00000560247 1708 ntTSL 1 (best)18.91■□□□□ 0.622e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 CCDC91-205ENST00000536442 1301 ntTSL 518.88■□□□□ 0.612e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.62e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.592e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 CCDC91-218ENST00000544649 665 ntTSL 318.73■□□□□ 0.592e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.582e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.575e-6■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 KATNBL1-202ENST00000540594 1267 ntTSL 218.38■□□□□ 0.532e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.532e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.492e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.492e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.492e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 SQSTM1-204ENST00000453046 572 ntTSL 417.95■□□□□ 0.462e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 SQSTM1-209ENST00000504627 602 ntTSL 517.95■□□□□ 0.462e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 SQSTM1-212ENST00000508284 578 ntTSL 417.95■□□□□ 0.462e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.452e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.442e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.432e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 DANCR-203ENST00000441504 336 ntTSL 217.67■□□□□ 0.422e-9■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.362e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 PSME3-216ENST00000593111 552 ntTSL 417.3■□□□□ 0.362e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.312e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 SOX13-202ENST00000367203 3525 ntTSL 1 (best)16.91■□□□□ 0.32e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.292e-9■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 AL365205.1-201ENST00000456057 3947 ntTSL 216.57■□□□□ 0.242e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 NOP53-212ENST00000600410 4185 ntTSL 216.5■□□□□ 0.232e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 RIPK1-203ENST00000479389 1481 ntTSL 316.27■□□□□ 0.192e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 NCAPD3-213ENST00000534532 5539 ntTSL 216.25■□□□□ 0.192e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.192e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 ACOX1-207ENST00000588176 574 ntTSL 416.22■□□□□ 0.192e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.162e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 AXIN1-204ENST00000461023 6340 ntTSL 215.8■□□□□ 0.122e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 RPRD1A-211ENST00000592674 566 ntTSL 415.72■□□□□ 0.112e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 RPRD1A-208ENST00000589050 1022 ntTSL 1 (best)15.72■□□□□ 0.112e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.092e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 RETSAT-205ENST00000449375 1759 ntTSL 515.11■□□□□ 0.012e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 02e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.012e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.012e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 NOP53-205ENST00000597985 656 ntTSL 314.94□□□□□ -0.022e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 NCAPD3-203ENST00000525964 5025 ntTSL 1 (best)14.94□□□□□ -0.022e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.022e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 TMUB2-206ENST00000587326 1839 ntTSL 1 (best)14.84□□□□□ -0.032e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 ACOX1-209ENST00000589301 550 ntTSL 414.77□□□□□ -0.052e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.052e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.065e-6■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 SQSTM1-205ENST00000464493 532 ntTSL 414.68□□□□□ -0.062e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 KATNBL1-214ENST00000560671 924 ntTSL 214.68□□□□□ -0.062e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.072e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 ACOX1-203ENST00000572047 2441 ntTSL 214.58□□□□□ -0.082e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.142e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.172e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 NOP53-203ENST00000594525 876 ntTSL 1 (best)13.96□□□□□ -0.172e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 AL365205.1-203ENST00000335515 2871 ntTSL 213.86□□□□□ -0.192e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.212e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 TMUB2-210ENST00000588413 747 ntTSL 213.67□□□□□ -0.222e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.252e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.282e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.322e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 TMUB2-203ENST00000446571 1580 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.332e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 TMUB2-207ENST00000587630 1191 ntTSL 312.8□□□□□ -0.362e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 AL365205.1-202ENST00000487182 3043 ntTSL 212.79□□□□□ -0.362e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 SLC2A9-209ENST00000506839 446 ntTSL 312.77□□□□□ -0.372e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 PYM1-206ENST00000549939 653 ntTSL 512.75□□□□□ -0.372e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.382e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.392e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.412e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 ADK-204ENST00000478611 443 ntTSL 312.43□□□□□ -0.422e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.435e-6■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 IL1R1-211ENST00000442590 577 ntTSL 312.2□□□□□ -0.462e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 SQSTM1-207ENST00000481335 562 ntTSL 412.1□□□□□ -0.472e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 RETSAT-203ENST00000429806 2335 ntTSL 1 (best)11.93□□□□□ -0.52e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 SLC2A9-207ENST00000505506 567 ntTSL 211.92□□□□□ -0.52e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC11.87□□□□□ -0.512e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 CLIP1-219ENST00000620786 5913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.532e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 SQSTM1-203ENST00000422245 628 ntTSL 411.51□□□□□ -0.572e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 IL1R1-209ENST00000428279 1525 ntTSL 511.45□□□□□ -0.582e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 RETSAT-204ENST00000438611 1500 ntTSL 511.45□□□□□ -0.582e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 ACOX1-204ENST00000573078 2417 ntTSL 211.38□□□□□ -0.592e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 CLIP1-203ENST00000361654 5568 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.612e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 CLIP1-209ENST00000537178 5229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.672e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 IL1R1-212ENST00000450319 549 ntTSL 310.83□□□□□ -0.682e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 CRYZ-205ENST00000417775 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.722e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 NCAPD3-201ENST00000525432 343 ntTSL 310.55□□□□□ -0.722e-7■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.731e-6■■■□□ 15.8
RBM22Q9NW64 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.731e-6■■■□□ 15.8
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