Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms