Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP8Q9BV40 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms