Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCM2Q9BSQ5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCM2Q9BSQ5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCM2Q9BSQ5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCM2Q9BSQ5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCM2Q9BSQ5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCM2Q9BSQ5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCM2Q9BSQ5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCM2Q9BSQ5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCM2Q9BSQ5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCM2Q9BSQ5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCM2Q9BSQ5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms