Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLF1Q9BQI6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms