Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BORCS6Q96GS4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BORCS6Q96GS4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms