Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFT1Q96AA3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms