Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms