Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT28Q7Z3Y7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms