Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TPTE2Q6XPS3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPTE2Q6XPS3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms