Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms