Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms