Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

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Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PPP1R3AQ16821 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R3AQ16821 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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