Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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