Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA3Q16281 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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