Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAPSQ13938 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms