Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRSQ13332 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms