Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STX4Q12846 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STX4Q12846 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STX4Q12846 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STX4Q12846 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
STX4Q12846 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
STX4Q12846 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STX4Q12846 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
STX4Q12846 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
STX4Q12846 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STX4Q12846 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms