Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3F3AP84243 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3F3AP84243 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms