Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAG2P55895 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAG2P55895 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAG2P55895 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms