Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO3P55854 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms