Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLTPP55058 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLTPP55058 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLTPP55058 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLTPP55058 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLTPP55058 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLTPP55058 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLTPP55058 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLTPP55058 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLTPP55058 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLTPP55058 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLTPP55058 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLTPP55058 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLTPP55058 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PLTPP55058 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLTPP55058 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms