Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms