Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RANGAP1P46060 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms