Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOBEC1P41238 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms