Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCVRNP35243 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCVRNP35243 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms