Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PEX2P28328 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PEX2P28328 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PEX2P28328 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms