Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PSMA3P25788 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms