Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MYF6P23409 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MYF6P23409 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MYF6P23409 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYF6P23409 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYF6P23409 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYF6P23409 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYF6P23409 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYF6P23409 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYF6P23409 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYF6P23409 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYF6P23409 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYF6P23409 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYF6P23409 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYF6P23409 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYF6P23409 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYF6P23409 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYF6P23409 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYF6P23409 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MYF6P23409 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MYF6P23409 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms