Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA1P17302 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA1P17302 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA1P17302 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA1P17302 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA1P17302 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA1P17302 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA1P17302 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA1P17302 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms