Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms