Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CREB1P16220 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CREB1P16220 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CREB1P16220 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CREB1P16220 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms